Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui pengaruh model pembelajaran Project Based Learning (PjBL) terhadap motivasi belajar siswa. Penelitian ini dilaksanakan di MIS Model Panyabungan. Metode penelitian yang digunakan adalah eksperimen dengan rancangan penelitian nonequivalent control group design. Pengambilan sampel dilakukan dengan menggunakan teknik purposive sampling. Sampel penelitian yang pertama berjumlah 26 siswa untuk kelas eksperimen dengan menggunakan model pembelajaran Project Based Learning (PjBL) berbantuan media Bloodstream Bottle. Sampel yang kedua berjumlah 28 siswa untuk kelas kontrol dengan menggunakan model pembelajaran konvensional. Analisis data proses kedua kelompok menggunakan uji-t diperoleh hasil yang menunjukkan peningkatan motivasi belajar siswa kelas eksperimen secara bertahap pada setiap pertemuan dari kategori cukup dengan skor rata-rata observasi 2,3 menjadi sangat baik dengan skor 3,6. Siswa pada kelas eksperimen memiliki rata-rata skor motivasi belajar yang lebih tinggi dibandingkan dengan siswa kelas kontrol. Hal ini menunjukkan bahwa terdapat pengaruh penggunaan model pembelajaran Project Based Learning (PjBL) berbantuan media Bloodstream Bottle terhadap motivasi belajar siswa kelas V MIS Model Panyabungan.